Ciencia Libre surgió como un proyecto de estudiantes de la Licenciatura en Física en la Escuela de Ciencias de la Universidad Autónoma "Benito Juárez de Oaxaca", con el objetivo de fomentar el interés por la física y las ciencias en la región. Uno de los hitos más destacados del proyecto fue la organización de la Semana Mundial del Espacio en Oaxaca por primera vez en 2009.
Sin embargo, debido a las responsabilidades personales de los integrantes, el proyecto se vio descuidado y finalmente quedó en manos de Mario y Carolina. En 2010, Mario dejó la Escuela de Ciencias para ingresar a la Facultad de Ciencias de la Universidad Autónoma de México, lo que llevó a una pausa temporal en el proyecto y a publicaciones esporádicas durante tres años.
En 2014, el proyecto se reactivó con la incorporación de dos nuevos colaboradores: Alejandra, estudiante de Física en la Facultad de Ciencias de la UNAM, y Marco, estudiante de Ingeniería Física en la Universidad de Guanajuato.
En la actualidad, Ciencia Libre continúa su labor de difusión científica y actualización. Carolina, ahora Doctora en Nanociencias, está comprometida en fortalecer este sitio y llevarlo a nuevos horizontes.